1946년 10월 당시는 아직도 조선건국준비위원회에 이어 중앙인민공화국 등 남로당을 중심으로 한 좌익계가 정국을 주도하고 있었다. 좌익 세력의 집권이 유력시되는 상황이었다. 박정희는 국군 장교였지만 집권 가능성이 큰 남로당에 입당한다. 바로 군내 남로당 프락치 조직원이었다.

박정희의 남로당 가입은 변신 이상에 해당하는 일종의 '반란 행위'였다. 당시 남한은 독립정부 수립의 일환으로 국군의 전신인 남조선국방경비대가 발족했으며 우파 민족주의와 자유민주주의가 그 지도이념이었다. 조선경비대의 주요임무가 좌익계열에 의한 폭동을 진압하는 일이었다. 그런 조선경비대의 장교가 정면 대립적인 공산주의 남로당에 가입한 것은 반란이 아닐 수 없다. 실제 당시 조선경비대에 침투한 남로당 조직은 1948년 한해만 4.3 제주폭동, 10.19 여수순천 반란, 11.2 대구반란 등 일련의 반란사건을 일으켰다. 박정희는 여순반란 사건이 일어난 후 군내 남로당 프락치 검거와 숙군 선풍이 불어 체포된다.